Цены, актуальная информация, надежность.
Ощутимых нет.
Сравнивал не так давно связной трэвэл и прямые условия от авиакомпании. В первом случае могут заморозить цену билета до оплаты, а вот в случае с авиакомпаниями нет никаких гарантий, что бронь будет держаться. Иногда авикомпании снимают неоплаченные забронированные билеты, если, например до вылета мало времени уже остается и есть желающие приобрести такой билет. Так что на всякий случай лучше бронировать через сервис вроде связного трэвэл.
Тут кстати и результат поиска в удобоваримой форме получаешь, и чтобы уж не упустить ничего пользуюсь календарем низких цен и подпиской на снижение цены.